Akademik Veri Yönetim Sistemi
Rakıcı E. (Yürütücü), Altan G., Dündar D., Özgümüş O. B.
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2025 - 2026
| Stenotrophomonas maltophilia kistik fibroz, diyabet, immunsupresyon ve malignensi gibi durumlarda ciddi enfeksiyonlara neden olan, mortalite ve morbitideyi arttıran fırsatçı bir patojendir. Neden olduğu enfeksiyonlara karşı birinci basamak tedavide trimetoprim/sulfametoksazol (TMP/SMX), ikinci basamak tedavide florokinolonlar tercih edilmektedir ve bu antibiyotiklere karşı direnç giderek artmaktadır. Dirence neden olan mekanizmalar arasında membran geçirgenliğinin azalması, akış pompalarının aşırı ekspresyonu, β-laktamaz enziminin varlığı ve yatay gen transferi yer almaktadır. Bu çalışmada klinik örneklerinden izole edilmiş ve antibiyotik duyarlılık testleri (minosiklin, levofloksasin, trimetoprim/sulfametoksazol) yapılmış olan 34 S. maltophilia izolatının PZR analizleri integronlarının (sınıf 1 ve sınıf 2) varlığı belirlenerek ve antibiyotik direnç genleri (sul, dfrA, Smqnr, L1 ve L2), kinolon direnç belirleyicileri (gyrA, gyrB, parC ve parE mutasyonları, qnrA, qnrB, qnrC, qnrD, qnrS ve aac(6′)-Ib-cr genleri), effluks genleri (sme efluks sistem genleri, OqxAB, qepA), biyofilm gelişiminde rol oynayan genler (rmlA , rpfF, spgM ve smf-1) taranacaktır. Ayrıca izolatların integronlarının sekans analizi yapılarak gen kaseti içerikleri belirlenecektir. Bazı izolatların tam genom analizi yapılarak, plazmid, transpozon vb. gibi mobil genetik elemanların moleküler yapıları aydınlatılacaktır. İzolatların klonal benzerliklerinin araştırılmasında PFGE (Pulsed Field Gel Elektroforezi)'nden elde edilen DNA paternlerine dendogram analizi yapılarak muhtemel yaygın ve/veya salgın klonları tespit edilecektir. Son yıllarda enfeksiyon etkeni olarak sıkça karşılaşılan S. maltophilia ile ilgili artan direnç klinik tedavide oldukça endişe vericidir. Bu direncin altında yatan genetik mekanizmaların detaylı bir şekilde aydınlatılması direncin önlenmesi çalışmaları ve tedavi stratejilerine önemli moleküler epidemiyolojik katkılar sağlayacaktır. |