KUMRU S. (Yürütücü), BALTA F., KALINDAMAR Ş.
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2020 - 2022
Lactococcus
garvieae Gram-pozitif kok seklindeki bir
bakteridir. L. garvieae sistemik
hastalıklara neden olan kok hastalığının etken ajanıdır. Hastalığa neden olan
bakterilerin tanımlanması, bakteriyel patojenite ve enfeksiyonların tedavisinin
anlaşılmasında gelişmiş tüm genom dizileme teknolojisi önem arz etmektedir. Bu
proje çalışmasında, daha öncesinde L.
garvieae olarak rapor edilen hastalık etmeni patojen bakteri izolatlarının
tüm genom dizilimi ortaya çıkarıldı. Tüm genom analizi sonucunda, bakterilerin L. garvieae değil L. petauri olduğu tespit edilmiştir. RAST ile yapılan tüm genoma ait analiz sonucunda, protein, fatty acids, amino acids ve
carbohydrates metabolizması gibi yapısal alt sistemlerdeki protein sayılarında
farklılıklar bulunmaktadır. Yapılan analiz sonucunda bakteri suşlarında farklı sayıda genomik adalar ve proteinler tespit edildi. Bacitracin dirençli bcrA geni yalnızca bu projede tüm genomu
ortaya çıkarılmış bakteri suşlarında bulunmakladır. Yapılan çalışmada, 6
bakteri suşlarından 1575 tane ortak gen kümesi tespit edildi. Virülans faktörü analizi sonucunda 6
bakteri de bulunan ortak 66 gen ve bakterilere özgü virülans faktörler tespit
edildi.