Akademik Veri Yönetim Sistemi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2021 - 2023
Pseudomonas cinsi Gram-negatif özellik gösteren, belirli şartlar altında vücutta enfeksiyonlara
neden olabilen bakterilerdir. Bitkiler, hayvanlar, insanlar ve sucul canlılar gibi çeşitli çevresel
ortamlarda bulunurlar. Gelişen teknoloji ve tüm genom dizilemenin yapılması ile bakterilerin
tüm genetik yapıları ortaya çıkarılmakta ve hastalık etkeni faktörler belirlenebilmektedir.
Dünya üzerinde farklı bölgelerden ve kaynaklardan elde edilen hastalık etmeni Pseudomonas
ile ilgili tüm genom çalışmaları bulunmaktadır. Bu çalışmada, 16S rRNA göre tanımlanmış
Pseudomonas cinsine ait suşların tüm genom dizilemesi yapıldı ve genomik-biyoinformatik
yaklaşımlarla genomların özellikleri ortaya çıkarıldı. Toplamda 9 bakterinin tüm genomu elde
edildi. Bunlardan 7 tanesinin türü belirlenirken (P. lundensis P. veronii, P. carnis P.
helmanticensis P. fulva P. rhodesiae, P. proteolytica) 2 bakterinin ise cins seviyesinde
tanımlaması yapılmıştır. Farklı kaynaklardan izole edilen referans genomlara karşı yapılan
karşılaştırmada çalışma kapsamında yapılmış tüm genomu dizilenmiş bakterilerin kendilerine
özgü antibiyotik dirençlilik genleri ve virülans genleri bulunmaktadır. Çalışma sonunda elde
edilen bakteri türleri sucul canlılardan rapor edilecek ilk tüm genomu yapılmış bakteri türleri
olacaktır. Bu çalışma sonuçları ile su ürünlerindeki hastalıkların tedavisi ve aşı geliştirmeyle
ilgili daha ileri çalışmalar için değerli bilgiler de sağlanmış olunacaktır.