Trabzon Yöresindeki Derelerden İzole Edilen Çoğul Antibiyotik Dirençli Koliform Bakterilerde Sınıf 1 İntegron Gen Kasetlerinin Moleküler Epidemiyolojisi


Creative Commons License

Özgümüş O. B. (Yürütücü), Sandallı C.

TÜBİTAK Projesi, 2007 - 2009

  • Proje Türü: TÜBİTAK Projesi
  • Başlama Tarihi: Ocak 2007
  • Bitiş Tarihi: Aralık 2009

Proje Özeti

Bu çalışmada Trabzon’un 10 deresinden izole edilen koliformlardaki antibiyotik direncinin moleküler karakterizasyonu ve sınıf 1 integron gen kaset taşıyıcılığı araştırıldı. Toplam 183 izolatın antimikrobiyal hassasiyet testleri disk difüzyon ve agar dilüsyon yöntemiyle yapıldı. Ampisilin, streptomisin, trimetoprim, tetrasiklin ve kloramfenikole karşı sırasıyla %58, %51.9, %24, %28.4 ve %12.5 oranında dirence rastlandı. On iki (%6.5) farklı filogenetik orijinli koliformda moleküler büyüklükleri 52 ile >147 Kbp arasında değişen kendini transfer edebilen direnç plazmitleri tespit edildi. Ampisilin, tetrasiklin, trimetoprim, streptomisin ve nalidiksik asit dirençleri transfer edilebilen dirençler arasındaydı. Transfer edilebilir nalidiksik asit direncine qnrS geni aracılık etti ve Türkiye’de çevre orijinli bakteride gösterilen ilk plazmit aracılı kinolon direnci olarak belirlendi. On dört suşta PZR ile (%7.6) sınıf 1 integron tespit edildi ve bazılarının plazmit üzerinde kodlandığı tespit edildi. Sınıf 1 integronların DNA dizi analizleri integronları dfrA1, dfr2d, dfrA7, dfrA16, dfrA17, aadA1, aadA5, blaOXA-30 gibi gen kasetleri taşıdığını gösterdi. dfrA16 geni taşıyan bir sınıf 1 integron ilk defa bir Citrobacter koseri izolatında bulundu. Tetrasiklin direnci doğal çevrelerde antibiyotik direncinin moniterazizasyonunda kullanılan anahtar bir belirteçtir. Toplam 52 tetrasikline dirençli koliformda PZR ile tetA, tetB ve tetC genleri tarandı ve sekiz suşta (%15.3) tetA, on (%19.2) suşta tetB ve bir (%1.9) suşta her iki gen tespit edildi. Trabzon’daki derelerin çoğul ilaç dirençli enterik bakterilerin ve çevrede antimikrobiyal direnç determinantları için bir rezervuarı olabileceği kanısındayız. Halk sağlığı açısından gerçek risk direnç genlerinin çevre bakterilerinden insan patojenlerine transferidir.