Karbapeneme Dirençli Pseudomonas aeruginosa İzolatlarında Biyofilm Gen Profili ve Moleküler Tiplendirme

TÜBİTAK Projesi, 2209-A - Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı, 2026 - 2027

Proje Türü: TÜBİTAK Projesi
Destek Programı: 2209-A - Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı
Başlama Tarihi: Mayıs 2026
Bitiş Tarihi: Mayıs 2027

Proje Özeti

Karbapenem dirençli Pseudomonas aeruginosa izolatları, hem antibiyotik direncinin çok yönlü mekanizmaları hem de güçlü biyofilm oluşturma yetenekleri nedeniyle hastane kaynaklı enfeksiyonlarda önemli bir küresel tehdit oluşturmaktadır. Bu bakterinin biyofilm oluşturma kapasitesi, kronik enfeksiyonların devamlılığında belirleyici bir faktördür. Biyofilm oluşumu; yüzeye tutunma, mikrokoloni gelişimi, matriks sentezi, olgunlaşma ve ayrılma aşamalarından oluşur ve çok sayıda gen tarafından kontrol edilir.

Bu proje, karbapenem dirençli P. aeruginosa izolatlarında biyofilmle ilişkili genlerin dağılımını belirleyerek gen profili ile antibiyotik direnç paternleri ve klonal ilişki arasındaki bağlantıyı ortaya koymayı amaçlamaktadır. Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na gelen örneklerden izole edilen imipenem ve/veya meropeneme dirençli 56 P. aeruginosa suşu çalışmaya dahil edilecektir. Suşların tanımlanması ve antimikrobiyal duyarlılık testleri VITEK® 2 sistemi ile gerçekleştirilecektir.

Toplam DNA ekstraksiyonları fenol:kloroform:izoamil alkol yöntemiyle yapıldıktan sonra biyofilm genleri (pslA, pelF, algD, lasR, rhlR, fliC, pilA) konvansiyonel PCR ile, klonal ilişkiler ise ERIC-PCR yöntemiyle analiz edilecektir. Elde edilecek veriler, biyofilm gen profili ile karbapenem direnci arasındaki ilişkiyi aydınlatarak P. aeruginosa’nın direnç ve virülans mekanizmalarının birlikte değerlendirilmesini sağlayacaktır. Ayrıca, sonuçlar biyofilm hedefli tedavi stratejilerinin geliştirilmesi, yerel epidemiyolojik izlem ve enfeksiyon kontrol politikalarının güçlendirilmesine katkı sunacaktır.