Akademik Veri Yönetim Sistemi
XLI. Türk Mikrobiyoloji Kongresini, Antalya, Türkiye, 13 - 17 Kasım 2024, cilt.1, ss.1, (Özet Bildiri)
Giriş ve Amaç: Dünyada her yıl halk sağlığı için, invaziv grup A beta-hemolitik streptokok (AGBHS) hastalıkları üzerine birçok çalışma yürütülmektedir. Araştırmalar yaklaşık 34 milyon kişinin etkilendiğini ve 10 milyondan fazla hastanın kalıcı olarak sakat kaldığını göstermektedir. AGBHS, Dünya Sağlık Örgütü tarafından dünya çapında insanları etkileyen dokuzuncu bulaşıcı hastalık olarak listelenmiştir. Çalışmamızda klinik örneklerden izole edilen AGBHS izolatlarında virulans genlerin varlığı, bakteriyofaj içeriği ve konak genişliği, bazı fajların karakterizasyonu planlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmada 2017-2019 yıllarında RTEÜ-EAH’de 40465587-050.01.04-81 nolu ve 29.04.2019 tarihli etik kurul kararı ile yüksek lisans tezi kapsamında izole edilen AGBHS’lar kullanıldı. Suşların basitrasin duyarlılığı, pirolidonil arilamidaz, katalaz testleri ve hızlı tanı kitiyle AGBHS olduğu doğrulandı. Kültür için %5-koyun kanlı agar, Todd–Hewitt ve Triptik-Soy sıvı besiyerleri kullanıldı. Antibiyotik direnç varlığı disk diffüzyon metodu ve EUCAST Klinik Sınır Değerleri kullanılarak belirlendi. AGBHS’lerden DNA izole edilerek emm moleküler tiplendirilmesi, CDC tarafından önerilen primerler kullanılarak yapıldı. Profaj indüksiyonu Mitomisin-C (0,2 µg/mL) kullanılarak yapıldı. PEG-çöktürmeyle bakteriyofaj yoğunlaştırıldı, SDS-PAGE profilleri belirlendi, TEM görüntüleri (ESOGÜ-ARUM’da) alındı, faj DNA izolasyonu, tüm genom sekanslaması ve biyoinformatik programlar kullanılarak analiz yapıldı. Çalışma “TÜSEB A-Grubu Acil AR-GE Projesi” (TB-16680) kapsamında desteklenmiştir. Bulgular ve Sonuç: Toplanan 85 adet AGBHS kullanıldı. İzolatlar; kültür pozitifliği, Gr(+) kok-zincir morfolojisi, beta-hemoliz özelliği, Basitrasin duyarlılığı ve SXT dirençliği belirlendi (Şekil-1). BO80’de eritromisin'e %13, tetrasiklin'e %30 direnç belirlenirken, BO93’de direnç gözlenmedi. İndüklenen lizatlarda çapraz (Cross) enfeksiyon yapıldı, izolatların %74’ünde faj varlığı ve geniş konak aralığı içerdikleri belirlendi (Tablo-1). Konaklarda 1/ ≥15 mm çapında açılma ve plak oluşumları gözlendi, en iyi konakların BO26 ve BO95 olduğu belirlendi. BO93 izolatında speC, speK ve speM, BO80 izolatında speA ve speC genleri belirlendi (Şekil-2). BO80 fajının 37802 bp nükleotid dizisine sahip linear DNA içerdiği, 52 okuma (ORF) bölgesinin olduğu, 6’sının (-), 46’sının (+) bölgede yer aldığı belirlendi. BLAST yapıldığında, 19 ORF bölgesinin fonksiyonu bilinen bir proteinle eşleştiği, diğer ORF’lerin hypothetical protein olduğu, BO80 fajının (Şekil-2), endolizin, hiyaluronidaz ve endopeptidaz bölgelerini içerdiği belirlendi.