Akademik Veri Yönetim Sistemi
23. Ulusal Biyoloji Kongresi, Gaziantep, Türkiye, 5 - 09 Eylül 2016, ss.95
Ülkemizde yayılış gösteren Tragopogon L.(Asteraceae) taksonları genomik DNA üzerinde yer alan ve sistematik çalışmalarda yaygın olarak kullanılan nrDNA ITS bölgeleri bakımından karşılaştırılmıştır. Total DNA’lar arazi çalışmalarıyla toplanan ve silika jel içerisinde muhafaza edilen sağlıklı yapraklardan kısmen değişikliğe uğratılmış CTAB protokolü kullanılarak elde edilmiştir. Evrensel ITS primerleri kullanılarak elde edilen PCR ürünlerinin nükletotit dizin analizleri mevcut cinse özel tasarlanan primerler kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Dış grup dahil tüm dizinler hizalandıktan sonra MEGA programı yardımı ile analiz edilmiştir. İncelenen taksonlara ait nrDNA-ITS bölge uzunluklarının 639-642 bç ve % GC içeriğinin ise 51,9-53,1 arasında değiştiği tespit edilmiştir. Tüm taksonların ITS bölgelerinin hizalanması sonucu 644 bç’den oluşan bir veri seti elde dilmiştir. Hizalanan bu veri setinin 29 (% 5)’u parsimonik (bilgi verici), 52 (% 8)’si değişken ve 589 (% 91)’unun korunmuş (değişmeyen) nükleotitlerden oluştuğu tespit edilmiştir. ITS bölgesinin NJ (Neighbour Joining) ve MP (Maximum Parsimony) analizleri sonucu elde edilen her iki filogenetik ağaçta Tragopogon taksonları, dış grup taksonlardan yüksek seç-bağla (NJ:100, MP:100) değerleri ile ayrılarak yekpare bir grup oluşturmuştur. Bu durum cinsin monofiletik olabileceği görüşünü desteklemektedir. Bununla beraber her iki filogenetik ağaç incelendiğinde çalışılan tüm taksonların iki ana grup altında kümelendiği tespit edilmiştir. Bu ana gruplardan biri yalnızca sarı ligulalı taksonlardan (T. dshimilensis K. Koch., T. fibrosus Freyn & Sint., T. graminifolius DC., T. albinervis Freyn & Sint., T. anatolicus A.Duran, B.Doğan & Coşkunç., T. turcicus Coşkunç., M.Gultepe & Makbul, T. vanensis M. Gultepe, Coşkunç. & Makbul, T. artvinensis Makbul, M. Gultepe & Coşkunç., T. aureus Boiss., T. buphthalmoides(DC.) Boiss. ve T. reticulatus Boiss. & Huet) oluşurken diğeri hem sarı (T. latifolius Boiss., T. oligolepisHartvig & Strid ve T. olympicus Boiss.) hem de sarı (T. dubius Scop. ve T. pratensis L.) ve mor ligulalı (T. coloratus C.A.Mey., T. porrifolius L., T. pterodes Panc., T. pterocarpus DC., T. subacaulis O. Schwarz) taksonlardan oluşan iki alt kola ayrılmıştır. Bu durum Tragopogon cinsinde filogenetik ilişkilerin ligula renginden bağımsız olduğu şeklindeki yorumları desteklemektedir.
Anahtar Kelimeler: Asteraceae, ITS, Lactuceae, Moleküler Analiz, Tragopogon