Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2024
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: MUHAMMET BAHATTİN ŞIHLI
Danışman: Gözde Yalçın Özkat
Özet:
Bu tez çalışması ile, hesaplamalı olarak yürütülen çalışmalar vasıtasıyla Ankilozan Spondilit hastalığının tedavisine yönelik yeni bir ilaç önder bileşiğinin geliştirilmesi hedeflenmiştir. Bu doğrultuda 2 basamaklı bir yöntem kullanılarak; ilk basamakta PharmMAPPER web aracı vasıtasıyla hedefe yönelik farmakofor modelleme, ikinci basamakta ise Ligandscout programı kullanılarak ligand temelli farmakofor modelleme gerçekleştirilmiştir. Ligandscout programından alınan 10 model için ZINCPharmer veri tabanı üzerinden taramalara gerçekleştirilerek 46 adet molekül elde edilmiştir. Daha sonra, bu moleküllerin in siliko ortamda ADME/Tox (Absorbsiyon, Dağılım, Metabolizma, İtrah, Toksisite) özellikleri incelenmiş ve ligand sayısı 5'e düşürülmüştür. AutoDock Vina programı vasıtasıyla, PKM2 enzimi ile 5 adet ligand molekülün moleküler kenetleme işlemi yapılarak bağlanma afiniteleri ve bağlanma profilleri belirlenmiştir. Tüm özellikler değerlendirildiğinde ZINC33366193, ZINC33686099, ZINC49539596, ZINC49539672, ZINC49539770 moleküllerinin Ankilozan Spondilit hastalığı için ilaç önder bileşikleri olabileceği ortaya konmuştur.