Atık Sulardan İzole Edilen Bakterileri Enfekte Eden Bakteriyofaj İzolasyonu


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2025

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: Fatma TUFAN

Danışman: Osman Birol Özgümüş

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Litik bakteriyofajlar, son derece spesifik, kendi kendini çoğaltan ve yan etkisi olmayan bir antimikrobiyal alternatif sunarken, antibiyotiklerin yanlış kullanımı ve aşırı kullanımı, çoklu ilaç dirençli (MDR) bakterilerin ortaya çıkmasını hızlandırmaya devam etmektedir. Bu çalışmada, yeni fajları izole etmek, klinik olarak önemli patojenlere karşı konakçı yelpazesini değerlendirmek ve ilk moleküler ve morfolojik karakterizasyonu yapmak amacıyla, Türkiye'nin Rize ilindeki beş antropojenik atık su çıkışının faj rezervuarı incelenmiştir. Zenginleştirme ve çift katmanlı plak testleri ile sekiz litik faj (Фd2d, Фd5d, Фd5t, Фd9d, Фt3d, Фt3s, Фt3t, Фt6d) ve beş duyarlı çevresel konak elde edilmiştir. Tek adımlı büyüme analizi ile belirlenen maksimum patlama boyutu 109 pfu/mL idi. Çapraz enfeksiyon testlerine göre, sekiz faj, Moraxellaceae, Enterobacteriaceae ve Pseudomonadaceae familyalarından on MDR klinik izolatını toplu olarak lize etti. Fajların temel biyolojik özelliklerini belirlemek amacıyla yapılan deneylerde, tek aşamalı üreme eğrisi analizinde maksimum patlama boyutu 10⁹–10¹⁰ pfu/mL aralığında bulundu; sıcaklık ve pH stabilite testlerinde çoğu fajın geniş aralıkta stabilitesini koruduğu görüldü.  Фd5d ile Фd5t ve Фt3d ile Фt3t'yi gruplandırarak, kısıtlama fragmanı uzunluğu polimorfizmi profili, yakın genomik akrabalık ortaya çıkardı. Фd9d ve Фt3d, transmisyon elektron mikroskobunda tipik siphovirus morfolojisi gösterdi. VITEK-2 otomatik sistemi, klinik izolatların antibiyotik duyarlılık modellerini belirlemek için kullanıldı ve yaygın çoklu ilaç direncini doğruladı. Bu bulgular bir araya getirildiğinde, atık suda terapötik olarak yararlı fajların bol miktarda bulunduğunu gösterir ve izole edilmiş litik fajları, gelecekte MDR Gram-negatif bakterileri hedefleyen faj tedavisi kokteylleri oluşturmak için geçerli seçenekler olarak belirler.