Klebsiella pneumoniae Suşlarında Antibiyotik Direnç Profillerinin Belirlenmesi Ve Karbapenemaz Direnç Allellerinin Araştırılması
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2024
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: ESİN KARAMAN
Danışman: Fatih Şaban Beriş
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Klebsiella pneumoniae hastaneye yatırılmış ve immun bağışıklığı baskılanmış kişilerde sağlık bakımı ilişkili enfeksiyonlara yol açan Gram negatif fırsatçı bir patojendir. Halk sağlığı için önemli bir tehdit olarak bilinen K. pneumoniae, hastane kaynaklı ve toplum kaynaklı enfeksiyonların en sık etkenidir. Çalışmamızda Rize Devlet Hastanesi'ndeki yoğun bakım ve servis hastalarının çeşitli klinik örneklerinden (kan, idrar, yara yeri sürüntü örneği, apse, doku örneği, balgam, bronko alveolar lavaj (BAL), dren, endotrakeal aspirat (ETA), intraabdominal mayi, safra, nefrotomi, katater ucu, fırça ucu, periton sıvısı, rektal sürüntü (RS) izole edilen ve son yıllarda direnç gelişmeye başladığı gözlemlenen karbapenem duyarlı olmayan K. pneumoniae suşlarının antibiyotik direnç genlerinin belirlenmesi ve replikon tiplendirmesi amaçlanmaktadır. Çalışmada 2015-2017 yılları arasında Rize Devlet Hastanesiden çeşitli örneklerden elde edilen 60 K. pneumoniae suşu dahil edilmiştir. Kirby-Bauer disk difüzyon testi ve Vitek-2 otomatik sistem (BioMerieux, Fransa) ile suşların antibiyotik duyarlılık testleri yapıldı.Suşlar -20 ve -80 derecede stoklandı. Antibiyotik direnç genleri (blaTEM, blaSHV, blaCTX-M1, blaCTX-M2, blaGES, blaVEB, blaPER, blaKPC, blaIMP, blaVIM, blaNDM, blaOXA-51, blaOXA-58, blaOXA-23, blaOXA-40 ve blaOXA-48) PZR yöntemi ile karakterize edildi. HI1, HI2, I1, X, L/M, N, FIA, FIB, W, Y, P, FIC, A/C, T, FIIs, FrepB ve K/B replikonlarına spesifik primerler ile replikon tiplendirmesi yapıldı. K. pneumaniae izolatlarının en çok yoğun bakım ünitesinden gönderilen örneklerden (n=24) izole edildiği saptanmıştır. Çalışmamızda, tüm izolatların kolistine duyarlı olduğu görülmüş; amikasin, amoksiklav, ampisilin, sefepim, sefotaksim, siprofloksasin, kolistin, ertapenem, imipenem, meropenem, piperasillin, tigesiklin ve gentamisine direnç oranları sırasıyla; %1.7, %98.4, %100, %65, %86.4, %71.7, %0, %100, %76.7, %85.04, %96.7,%15.1, %38.4 olarak belirlenmiştir. İzolatlarda en sık olarak blaOXA-48 geni saptanmış olup, izolatların 58 (%96.6) tanesinde tek başına blaOXA-48 tespit edilmiştir. En sık I1 plazmit tipine rastlanılmış olup aynı zamanda farklı beş suşta 3 farklı plazmit tipine rastlanılmıştır. Yaptığımız bu çalışmayla K. pneumoniae'nın neden olduğu infeksiyonlarda antibiyotik direnç riskinin ve direnç yayılımının indirgenmesine katkı sağlayarak gelecekteki tedavi yöntemleri için fikir vermesi ve çalışacağımız gen bölgelerinin saptanmasıyla kritik hasta gruplarında antibiyotik seçiminde yol gösterici olması beklenmektedir.