Asst. Prof. AYŞENUR EMİNOĞLU

Metrics

Publication

Publication (WoS)

Publication (Scopus)

Citation (WoS)

H-Index (WoS)

Citation (Scopus)

H-Index (Scopus)

H-Index (Scholar)

Citation (TrDizin)

H-Index (TrDizin)

Citation (Sum Other)

Project

Intellectual Property

Thesis Advisory

Open Access

UN Sustainable Development Goals

Education

2013 - 2018

Doctorate

Karadeniz Technical University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji/Moleküler Biyoloji, Turkey

2015 - 2017

Doctorate

Dartmouth College, Thayer School Of Engineering , Chemical And Biochemical Engineering / Energy Technologies , United States Of America

2010 - 2012

Postgraduate

Recep Tayyip Erdogan University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Anabilimdalı / Moleküler Biyoloji , Turkey

2003 - 2004

Postgraduate

Selcuk University, Instıtute Of Scıence, Ortaöğretim Fen Ve Matematik Alanları Eğitimi, Turkey

1999 - 2003

Undergraduate

Selcuk University, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji, Turkey

Dissertations

2018

Doctorate

Modification of Hydrogen Metabolism for Improved Ethanol Production in Thermophilic Bacteria (İngilizce)

Karadeniz Technical University, Fen Bilimleri Enstitüsü, BİYOLOJİ/ MOLKEÜLER BİYOLOJİ

2012

Postgraduate

Anoxybacillus flavithermus WK1 AfCDA geninin klonlanması, ekspresyonu, saflaştırılması ve biyokimyasal karakterizasyonu

Recep Tayyip Erdogan University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Anabilimdalı / Moleküler Biyoloji Bilim Dalı

Foreign Languages

C1 Advanced

English

Certificates, Courses and Trainings

2014

Bitki Biyoteknolojisinde DNA Markır Uygulamaları ve Gen İfadesi Analiz Yöntemleri

Vocational Course

Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü

2009

Bilgisayar İşletmenliği

IT

MEB

Research Areas

Biofuels

Biotechnology and Genetics

Molecular Biotechnology

Metabolic Engineering

Enzymology

Molecular Biochemistry

Bioinformatics

Biological Modelling

Biological Databases

Microbial Biotechnology

Molecular Biology and Genetics

Plant Molecular Genetics

Genetic Engineering

Neurobiology

Fermentation

Research Areas Based on Academic Activities

Avesis Research Areas

WoS Research Areas

Scopus Research Areas

Academic Positions

2022 - Present

Assistant Professor

Recep Tayyip Erdogan University, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü

2018 - 2022

Research Assistant PhD

Recep Tayyip Erdogan University, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü

2011 - 2018

Research Assistant

Recep Tayyip Erdogan University, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü

2015 - 2017

Other

Dartmouth College, Thayer School Of Engineering / Chemical And Biochemical Engineering / Energy Technologies, Chemical And Biochemical Engineering / Environmental Engineering

Courses

Postgraduate

Uzmanlık Alan Dersi-II

Biyoinfotmatik Analizler

Yüksek Lisans Tezi

Nükleik Asitler ve Biyomühendislik

Seminer

Bakterilerin Moleküler Genetiği

Moleküler Biyoteknoloji

Undergraduate

Genetik Mühendisliği

Mesleki İngilizce-III

Moleküler Biyoloji

Biyoteknoloji

Biyoinformatik

Biyoproses Mühendisliği

Moleküler Biyoloji Laboratuvarı

Supervised Theses

2025

Postgraduate

Çay [Camellia sinensis (L.) O. Kuntze] Bitkisi ve Toprağı ile Etkileşimli, Fitohormon Degrade Eden Bakterilerin İzolasyonu ve Enzim Aktivitelerinin Belirlenmesi

Eminoğlu A. (Advisor)

A.YILMAZ(Student)

2025

Postgraduate

Dini İnancın VMAT2/Slc18a2 Gen Ekspresyonu Üzerine Etkisinin Belirlenmesi

Eminoğlu A., Vural M. E. (Co-Advisor)

C.YILDIZ(Student)

Taught Courses and Trainings

2022 - 2022

Çayda Uygulamalı Moleküler Teknikler Eğitimi I

Application Research Center - Training

Eminoğlu A., Beriş F. Ş., Güzel İzmirli Ş.

Articles

2026

1. A low-toxicity surface sterilization approach for efficient in vitro propagation of tea (Camellia sinensis (L.) O. Kuntze) using alternative antifungal agents

DİNÇER D., Dundar H., BEKİRYAZICI F., EMİNOĞLU A., GÜZEL İZMİRLİ Ş., BERİŞ F. Ş., et al.

SOUTH AFRICAN JOURNAL OF BOTANY , vol.188, pp.180-190, 2026 (SCI-Expanded, Scopus)

2025

2. **SSR genotyping of 200 tea (Camellia sinensis) clones obtained by selection and DNA barcoding of 12 varietal registration candidates**

Eminoğlu A., Izmirli S. G., Beriş F. Ş., Dinçer D., Yazıcı K.

BMC PLANT BIOLOGY , vol.25, no.1, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)

2025

3. **Molecular diversity of Klebsiella pneumoniae clinical isolates: antimicrobial resistance, virulence, and biofilm formation**

Kafa A., Aslan R., Dastan S., ÇELİK C., Hasbek M., EMİNOĞLU A.

NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS , vol.44, no.5, pp.361-377, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)

2021

4. **SURVEY FOR THE PATHOGENIC CHYTRID FUNGI BATRACHOCHYTRIUM DENDROBATIDIS AND B. SALAMANDRIVORANS ON THE CAUCASIAN SALAMANDER IN NORTHEASTERN TURKEY**

Altunışık A., Gül S., Altunisik S., Eminoğlu A.

HERPETOLOGICAL CONSERVATION AND BIOLOGY , vol.16, no.3, pp.534-541, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)

2018

5. Molecular and in silico cloning, identification, and preharvest period expression analysis of a putative cytochrome P450 monooxygenase gene from Camellia sinensis (L.) Kuntze (tea)

Eminoğlu A., Akturk Dizman Y., Guzel Ş., Beldüz A. O.

TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY , vol.42, no.1, pp.1-11, 2018 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)

2017

6. Deletion of the hfsB gene increases ethanol production in Thermoanaerobacterium saccharolyticum and several other thermophilic anaerobic bacteria

Eminoğlu A., Murphy S. J., Maloney M., Lanahan A., Giannone R. J., Hettich R. L., et al.

BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS , vol.10, 2017 (SCI-Expanded, Scopus)

2016

7. Sulfonamide inhibition studies of the beta-carbonic anhydrase from the newly discovered bacterium Enterobacter sp B13

Eminoğlu A., Vullo D., Asik A., Çolak D. N., Çanakçı S., Beldüz A. O., et al.

BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS , vol.26, no.7, pp.1821-1826, 2016 (SCI-Expanded, Scopus)

2016

8. Cloning, expression and biochemical characterization of a beta-carbonic anhydrase from the soil bacterium Enterobacter sp B13

Eminoğlu A., Vullo D., Asik A., Colak D. N., Supuran C. T., Çanakçı S., et al.

JOURNAL OF ENZYME INHIBITION AND MEDICINAL CHEMISTRY , vol.31, no.6, pp.1111-1118, 2016 (SCI-Expanded, Scopus)

2015

9. Cloning, Purification and Characterization of Acetyl Xylane Esterase from Anoxybacillus flavithermus DSM 2641(T) with Activity on Low Molecular-Weight Acetates

Eminoğlu A., Ulker S., Sandallı C.

PROTEIN JOURNAL , vol.34, no.4, pp.237-242, 2015 (SCI-Expanded, Scopus)

Papers Presented at Peer-Reviewed Scientific Conferences

2024

1. Doku Kültürüyle Üretilen Türk Çay Genotiplerinde Somaklonal Varyasyonun SSR Markörler Kullanılarak Tespiti

Eminoğlu A., Güzel İzmirli Ş., Beriş F. Ş., Dinçer D., Yazıcı K.

7th International Anatolian Agriculture, Food, Environment and Biology Congress, Kastamonu, Turkey, 26 - 29 September 2024, pp.85, (Summary Text)

2024

2. Seleksiyonla Elde Edilen Çay Çeşit Adaylarının Genotiplendirilmesinde SSR Markörlerin Değerlendirilmesi

Eminoğlu A., Güzel İzmirli Ş., Beriş F. Ş., Dinçer D., Polat A., Yazıcı K.

Ulusal Çay Kongresi, Rize, Turkey, 21 - 23 May 2024, pp.1-2, (Summary Text)

2024

3. TÜRKİYE ULUSAL ÇAY GEN HAVUZUNUN KURULMASI

Yazıcı K., Polat A., Haznedar A., Çeper Ilgaz Ş., Akbulut M., Şavşatlı Y., et al.

ULUSAL ÇAY KONGRESİ, Rize, Turkey, 21 - 23 May 2024, pp.18-19, (Summary Text)

2024

4. Seleksiyon Sonrası Seçilmiş En İyi Çay Çeşitlerinin Doku Kültürü ile Üretiminde Sürgün Oluşumu için En Uygun Oksin ve Dozlarının Belirlenmesi

Dinçer D., Dündar H., Bekiryazıcı F., Eminoğlu A., Güzel İzmirli Ş., Beriş F. Ş., et al.

Ulusal Çay Kongresi, Rize, Turkey, 21 - 23 May 2024, pp.24, (Summary Text)

2018

5. Camellia sinensis (L.) Kuntze (Çay) Bitkisine Ait Sitokrom P450 Monooksijenaz Geninin Genetik Polimorfizminin Belirlenmesi

EMİNOĞLU A., AKTÜRK DİZMAN Y., GÜZEL Ş.

1st International Plant Biology Congress (ICONBP), Konya, Turkey, 10 - 12 May 2018, vol.X, (Summary Text)

2017

6. Introducing thermophilic high ethanol-yielding producing pathways into Clostridium thermocellum

Hon S., Olson D. G., Holwerda E., Murphy S. J., Tian L., Lanahan A., et al.

39th Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals (SBFC), San Fransisco, United States Of America, 1 - 12 May 2017, vol.., pp.1, (Full Text)

2016

7. Understanding the Role of HfsB in Clostridium thermocellum for Improved Ethanol Production

EMİNOĞLU A., Olson D. G., Lynd R. L.

14th International Conference on the Genetics, Physiology and Synthetic Biology of Solvent- and Acid-forming Clostridia, Hanover Nh, United States Of America, 28 - 31 August 2016, vol.14, no.87, pp.62, (Full Text)

2016

8. Heterologous expression of mutant Thermoanaerobacterium saccharolyticum hfs hydrogenase for improving Ethanol production in ?hydG?ech strain of Clostridium thermocellum

EMİNOĞLU A., Olson D. G., Beldüz A. O., Lynd R. L.

5th International Molecular Biology and Biotechnology Congress' 2016, Üsküp, Macedonia, 25 - 29 August 2016, vol.1, no.1, (Summary Text)

2016

9. Understanding the role of the hfs hydrogenase in Thermoanaerobacterium saccharolyticum

EMİNOĞLU A., Olson D. G., Lynd R. L.

2016 SIMB Annual Meeting and Exhibition, New Orleans, United States Of America, 24 - 28 July 2016, vol.1, no.11, pp.1, (Full Text)

2015

10. Prolin-Kuyruğun Anoxybacillus sp. Litik Murein Transglikosilazın Optimum Sıcaklık ve pH’sı Üzerine Etkisi

Ceylan E., EMİNOĞLU A., Güler H. İ., Kurnaz Z., Beldüz A. O.

Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi, Afyon, Turkey, 21 - 24 August 2015, vol.1, no.1, pp.64, (Full Text)

2014

11. In silico Analysis and Comparative Modelling of Camellia sinensis Heat Shock Protein 70 (Hsp70)

EMİNOĞLU A., Özer A.

3rd Molecular Biology and Biotechnology Congress, Bosna Hersek, Bosnia And Herzegovina, 2 June - 06 February 2014, vol.1, no.166, pp.220, (Full Text)

2014

12. Expression and Zymogram Analysis of a ß-class Carbonic Anhydrase from Enterobacter asburiae

EMİNOĞLU A., Aşık A., Çolak D. N., Çanakçı S., Beldüz A. O.

3rd Molecular Biology and Biotechnology Congress, Bosna Hersek, Bosnia And Herzegovina, 2 June - 06 February 2014, vol.1, no.167, pp.219, (Full Text)

2012

13. Anoxybacillus flavithermus WK1’den Ksilanaz/Kitin deasetilazGeninin Klonlanması, Ekspresyonu, Saflaştırılması ve EnzimatikKarakterizasyonu

EMİNOĞLU A., SANDALLI C.

21.Ulusal Biyoloji Kongresi, İzmir, Turkey, 3 - 07 September 2012, vol.21, pp.1357-1358, (Full Text)

Funded Projects

2025 - 2025

Bilim için Aile, Aile için Bilim Şenliği

TUBITAK Project , 4007 - Bilim Şenlikleri Destekleme Programı

Aytan Ü., ALTUN E., EMİNOĞLU A.

2024 - 2025

Dini İnancın VMAT1/Slc18a1 ve VMAT2/Slc18a2 Gen Ekspresyonları Üzerine Etkisi

TUBITAK Project , 1002 - Quick Support Program

Eminoğlu A. (Executive), Vural M. E.

2024 - 2025

DİNİ İNANCIN VMAT2/SLC18A2 GEN EXPRESYONU ÜZERİNE ETKİSİNİN BELİRLENMESİ

Project Supported by Higher Education Institutions , BAP MSc

(Project Abstract)

EMİNOĞLU A. (Executive), YILDIZ C., VURAL M. E.

2024 - 2025

Çay Camellia sinensis L O Kuntze Bitkisi ve Toprağı ile Etkileşimli Fitohormon Degrade Eden Bakterilerin İzolasyonu ve Enzim Aktivitelerinin Belirlenmesi

Project Supported by Higher Education Institutions , BAP MSc

EMİNOĞLU A. (Executive), YILMAZ A.

2024 - 2024

Concept Conversations

Project Supported by Higher Education Institutions , University Supported Other Projects

(Project Abstract) (Project Final Report)

Karadeniz İ., Köse H. İ., Köktaş Y., Eminoğlu A., Alber F.(Executive)

2019 - 2024

Çay Bitkisi Gen Havuzunun Oluşturulması ve Ticari Çay Çeşit Adaylarının Belirlenmesi (TÜBİTAK 1007) (İŞ PAKETİ LİDERİ-ARAŞTIRMACI)

TUBITAK Project , 1007 - Public Institutions Research and Development Projects DP

Yazıcı K.(Executive), Akbulut M., Kalkışım Ö., Beriş F. Ş., Dinçer D., Şavşatlı Y., et al.

2020 - 2023

ÇAY EĞİTİM PROJESİ

Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project

YAZICI K. (Executive), BİLGİN A., AKBULUT M., BERİŞ F. Ş., DİNÇER D., ŞAVŞATLI Y., et al.

2021 - 2022

“Siyah Rize Çayına Dem Rengini Veren Maddelerin Miktarlarının Dem Rengi Üzerine Etkilerinin Tespit Edilmesi” (TÜBİTAK öğrenci Projesi) (DANIŞMAN)

TUBITAK Project , 2209-A - Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı

Eminoğlu A., Dönmez G.(Executive)

2018 - 2020

Acanthamoeba castellanii Beta-Glukosidaz (Aca1) geni cDNA’sının klonlanması

Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project

Taşkın Kafa A. H.(Executive), Eminoğlu A., Akın Polat Z.

2015 - 2017

Metabolic Engineering of Cellulolytic Microbes for Production of Biofuels (ARAŞTIRMACI)

Other International Funding Programs

Eminoğlu A., Olson D. G., R. Lynd L.(Executive)

2014 - 2015

Camellia sinensis (L.) Kuntze (Çay) Bitkisine Ait Sitokrom P450 Monooksijenaz Geninin Klonlanması, Moleküler Karakterizasyonu ve Genetik Polimorfizminin Belirlenmesi (TÜBİTAK 1002) (YÜRÜTÜCÜ)

TUBITAK Project , 1002 - Quick Support Program

Eminoğlu A. (Executive), Aktürk Dizman Y.

2011 - 2013

polA Geni Açısından Mutant ve Yaban Tip Geobacillus thermoglicosidasius Hücrelerinde Büyüme Hızlarının Karşılaştırılması

Project Supported by Higher Education Institutions , BAP MSc

SANDALLI C.(Executive), SEVİM E., EMİNOĞLU A., SARAL SARIYER A.

2009 - 2011

Farklı bölgelerde ana ürün koşullarında yetiştirilen melez atdişi mısır (Zea mays indentata L.) çeşitlerinin verim ve yaş öğütme kalitesinin belirlenmesi

TUBITAK Project , 1001 - Program for Supporting Scientific and Technological Research Projects

Sayaslan A.(Executive)

Patent

2020

Increased ethanol production by thermophilic microorganisms with deletion of individual hfs hydrogenase subunits

Patent

Registered / Approved, The Invention Registration Number: US10619172 , Standard Registration

Peer Reviews in Scientific Publications

November 2023

PARASITOLOGISTS UNITED JOURNAL

National Scientific Refreed Journal

November 2022

Afyon Kocatepe Üniversitesi Fen ve Mühendislik Bilimleri Dergisi

National Scientific Refreed Journal

March 2021

Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi Fen Ve Mühendislik Bilimleri Dergisi

National Scientific Refreed Journal

January 2020

JOURNAL OF ANATOLIAN ENVIRONMENTAL AND ANIMAL SCIENCES

National Scientific Refreed Journal

Scientific Project Refereeing

October 2022

Project Supported by Higher Education Institutions

BAP Research Project, Hacettepe University, Turkey

December 2020

Project Supported by Higher Education Institutions

BAP MSc, Akdeniz University, Turkey

Scientific Consultations

2021 - 2022

Project Consultancy

TÜBİTAK

Recep Tayyip Erdogan University, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Turkey

Roles in Event Organizations

November 2020

Uluslararası Biyoçeşitlilik Araştırmaları Sempozyumu

Scientific Congress

Eminoğlu A.

Rize, Turkey

Mobility Activity

2015 - 2017

Research Scholarship Program

Research During Graduate Education

Dartmouth College, United States Of America

Awards

April 2018

UBYT Yayın Teşvik Ödülü

TÜBİTAK

Congress and Symposium Activities

01 August 2016 - 01 August 2016

14th International Conference on the Genetics, Physiology and Synthetic Biology of Solvent- and Acid-forming Clostridia

Attendee

New Hampshire-United States Of America

01 August 2016 - 01 August 2016

14th International Conference on the Genetics, Physiology and Synthetic Biology of Solvent- and Acid-forming Clostridia

Attendee

New Hampshire-United States Of America

01 July 2016 - 01 July 2016

SIMB Annual Meeting and Exhibition

Attendee

Louisiana-United States Of America

01 June 2016 - 01 June 2016

Bioenergy Science Center (BESC) Science Retreat

Attendee

Tennessee-United States Of America

01 June 2016 - 01 June 2016

Bioenergy Science Center (BESC) Science Retreat

Invited Speaker

Tennessee-United States Of America

01 June 2014 - 01 June 2014

3rd Molecular Biology and Biotechnology Congress

Attendee

Sarajevo-Bosnia And Herzegovina

01 September 2012 - 01 September 2012

21. Ulusal Biyoloji Kongresi

Attendee

İzmir-Turkey

Scholarships

2016 - 2017

2214-A - Yurt Dışı Doktora Sırası Araştırma Bursu, Dartmouth College, Thayer School of Engineering, USA

TUBITAK

Citations

Total Citations (WOS): 47

h-index (WOS): 4

Scientific Research / Working Group Memberships

2018 - Present

Çay ve Çay Ürünleri Uygulama ve Araştırma Merkezi

http://cay.idari.erdogan.edu.tr/

RECEP TAYYİP ERDOĞAN ÜNİVERSİTESİ, Turkey

2016 - 2017